生物分析软件构建
构建具有自主知识产权的芯片分析软件和数据库系统也是我们努力的目标。至今我们 已经自主研发出两套芯片分析软件和两套芯片分析数据库系统，并申请了二项软件著作权。
凋亡基因芯片(Apoptosis PCR Array )
细胞凋亡RT2 Profiler™ PCR Array可以同时测定84个与凋亡即细胞程序性死亡有关的关键基因。其中包括TNF配基及其受体，Bcl-2家族成员、caspase、IAP、TRAF、CARD
啤酒酵母CGH芯片385K酵母全基因组CGH芯片酵母比较基因组杂交芯片
啤酒酵母CGH芯片385K酵母全基因组CGH芯片酵母比较基因组杂交芯片S. cerevisiae CGH 385K Whole-Genome Tiling Array
斑马鱼CGH芯片385K斑马鱼全基因组CGH芯片斑马鱼比较基因组杂交芯片
斑马鱼CGH芯片385K斑马鱼全基因组CGH芯片斑马鱼比较基因组杂交芯片Zebrafish CGH 385K Whole-Genome Tiling Array
lncRNA 芯片
长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）是一类转录本长度超过200nt、不编码蛋白的RNA，起初被认为是基因组转录的“噪音”，不具有生物学功能。
P. aeruginosa Genome Array 绿脓杆菌
该芯片覆盖了P. aeruginosa strain PA01的基因组, 包括 5,549个蛋白编码序列, 18 个tRNA基因, 和117非PA01基因, 等等。